| Le porc |
| Contact |
Claire ROGEL-GAILLARD, INRA/AgroParisTech, UMR1313, Laboratoire de Génétique Animale et Biologie Intégrative, équipe INRA-CEA Génétique Immunité Santé,
Jouy-en-Josas, 
| Données générales |
Sus scrofa domestica pour le porc domestique et Sus scrofa scrofa pour le sanglier
Classification phylogénétique : mammifères de la famille des Suidae
Génome Sus scrofa scrofa
Taille attendue du génome: 2,7 Gb
2n = 38 chromosomes
Premier assemblage de la séquence du génome disponible
| Reproduction et longévité |
Les porcs atteignent la maturité sexuelle très tôt vers l'âge de 6 mois et peuvent se reproduire tout au long de l’année. Le temps de gestation est de 115 jours en moyenne. Une truie peut avoir deux portées par an et met bas jusqu’à une douzaine de porcelets par portée. Certaines lignées qualifiées de très prolifiques peuvent donner naissance à 18 porcelets par portée. La truie gestante a une placentation épithélio-choriale qui limite les échanges entre le sang maternel et fœtal. Un porc a une espérance de vie de 25 ans.
| Disciplines principales |
Biologie du développement
Biologie cellulaire
Biologie moléculaire
Clonage
Transgenèse
Immunologie
Génétique
Génomique comparative
Modèle de maladies humaines : mélanome, pathologies cardio-vasculaires, ischémie, athérosclérose, obésité
Modèle en recherche biomédicale : Xénotransplantations, chirurgie expérimentale, toxicité transdermique, fibrose cutanée radio induite
| Outils disponibles |
Capacité d’élevage dans des conditions contrôlées
Installations SPF (Specific Pathogen Free)
Banques de grands fragments d’ADN (BACs)
Transfections cellulaires
Transgenèse
Cartes physiques, génétiques, cytogénétiques, d’hybrides d’irradiation
Séquence génomique partielle
Puces d’expression pour des analyses transcriptomiques
Génotypage : microsatellites, SNPs
Puces 60K SNP disponibles
Anticorps
| Databases |
Races de porc domestique :
http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_domestic_pig_breeds
Cartographie et cartographie comparée :
Animal genome database :
http://www.animalgenome.org/QTLdb/pig.html
Carte cytogénétique :
https://www-lgc.toulouse.inra.fr/pig/cyto/cyto.htm
Cartes homme-porc :
https://www-lgc.toulouse.inra.fr/pig/compare/compare.htm
Carte physique:
http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_scrofa/mapping.shtml
Cartographie comparée de séquences
EST :
http://bioinfo.genotoul.fr/Iccare/index.php
Génomes :
http://narcisse.toulouse.inra.fr/multi/cgi-bin/narcisse17.cgi
Annotation EST et ADNc :
Pig expression data explorer :
http://pede.dna.affrc.go.jp/
SIGENAE :
http://www.sigenae.org/
Pig gene Index :
http://compbio.dfci.harvard.edu/tgi/cgi-bin/tgi/gimain.pl?gudb=pig
Séquence du génome : premier assemblage disponible (octobre 2009) :
http://www.ensembl.org/Sus_scrofa/Info/Index
http://vega.sanger.ac.uk/Sus_scrofa/index.html
Projet de séquençage du génome :
http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_scrofa/
Swine Genome Sequencing Consortium (SGSC) :
http://www.piggenome.org/The Immuno Polymorphism Database
MHC database :
http://www.ebi.ac.uk/ipd/mhc/sla/
Porcine Immunology and Nutrition database :
http://ars.usda.gov/Services/docs.htm?docid=6065
Recherches biomédicales chez le porc :
http://www.nal.usda.gov/awic/pubs/swine/swine.htm#art
| Introduction |
Le porc domestique et le porc sauvage ou sanglier appartiennent tous deux à l’espèce Sus Scrofa. Le porc domestique est classé en Sus scrofa domestica et le sanglier le plus commun en Sus scrofa scrofa. Le porc domestique et le sanglier sont interféconds. Ils diffèrent par leur nombre de chromosomes : 36 pour le sanglier et 38 pour le porc domestique. L’espèce porc a été domestiquée suite à la sédentarisation des hommes et à l’apparition de l’agriculture il y a environ 10000 ans.
Le porc domestique est une espèce d’intérêt économique et biomédical. Il constitue un modèle en santé humaine de par l’existence de caractéristiques anatomiques et physiologiques comparables à celles de l’homme: structure de la peau, réponse à des régimes athérogènes, anatomie cardio-vasculaire, système urinaire, anatomie et fonctionnement du rein. Les propriétés anatomiques et physiologiques d’organes tels le foie, le pancréas, le rein et le cœur font du porc un animal reconnu d’intérêt pour la xénogreffe. L’anatomie gastro-intestinale du porc diffère de celle de l’homme mais les processus digestifs étant similaires, le porc est intéressant pour l’étude de pathologies digestives. Il existe des races de porcs miniatures (Yucatan, Hanford, Gottingen) précieuses dans des protocoles expérimentaux pour lesquels la taille des animaux de ferme serait un obstacle.
| Ressources |
ANIMAUX :
- Races de porcs domestiques :
Génétique et Expérimentation en Productions Animales, INRA
- Lignée athérosclérose :
Animaux présentant une athérosclérose spontanée
Génétique et Expérimentation en Productions Animales, INRA
- Lignée MeLiM :
Animaux ayant une susceptibilité génétique au mélanome cutané
UMR1313 de Génétique Animale et Biologie Intégrative, INRA
- Miniporcs homozygotes pour l’haplotype dd du CMH :
UR Infectiologie Animale et Santé Publique, INRA
CHIRURGIE EXPERIMENTALE :
Unité de Physiologie, reproduction et comportement, INRA, Tours
TRANSPLANTATIONS :
Plateforme de chirurgie du Magneraud
BANQUES DE BACs :
CRB GADIE, Jouy-en-Josas, France :
Distribution de clones, criblage par PCR
BACPAC resources center, USA
MICROARRAYS :
CRB GADIE, Jouy-en-Josas, France
USA pig genome coordination
PUCES SNPs :
PorcineSNP60 Genotyping BeadChip
TYPAGE DU CMH :
UMR1313, Laboratoire de Génétique Animale et Biologie Intégrative, équipe INRA-CEA Génétique Immunité Santé, INRA/AgroParisTech, Jouy-en-Josas
PANEL D'HYBRIDES D'IRRADIATION (RH) :
IMPRH, INRA : Distribution du panel et outil de cartographie RH
| Infrastructures |
INRA, UMR Physiologie de la Reproduction et des Comportements, Tours Nouzilly :
http://www.tours.inra.fr/physiologie_...
Cytogénétique, épigénétique, topologie nucléaire, INRA, Laboratoire de Génétique Cellulaire, Toulouse :
https://www-lgc.toulouse.inra.fr/internet/
Anomalies génétiques, INRA, Laboratoire de Génétique Cellulaire, Toulouse :
https://www-lgc.toulouse.inra.fr/internet/
Biodiversité, INRA, Laboratoire de Génétique Cellulaire, Toulouse :
https://www-lgc.toulouse.inra.fr/internet/
Génétique quantitative et dispositifs familiaux pour des études génétiques, Contrôle génétique de la réponse immunitaire, Mélanome cutané héréditaire (modèle biomédical MeLiM), Complexe majeur d‘histocompatibilité, Cartographie et cytogénétique :
INRA-AgroParisTech, UMR1313 de Génétique Animale et Biologie Intégrative, Jouy-en-Josas :
http://www.inra.fr/genetique_animale/les_unites/...
Immunologie des muqueuses, INRA, Infectiologie Animale et Santé Publique, Nouzilly :
http://www.tours.inra.fr/Pole_Sante_Animale/...
http://www.tours.inra.fr/les_recherches/...
Maladies infectieuses, interactions hôte pathogènes, vaccins, INRA, unité de Virologie et Immunologie Moléculaires :
http://www.jouy.inra.fr/vim
AFSSA, Unité virologie et immunologie porcines :
http://www.ploufragan.afssa.fr/organisation/uvip.htm
Immunité et toxicologie, INRA, Unité de Recherche Pharmacologie-Toxicologie, 31931 St Martin du Touch :
http://www.toulouse.inra.fr/pharmacologie_toxicologie
Chirurgie expérimentale, Étude de l'ischémie-reperfusion de différents organes, en particulier le rein, Inserm U927 Centre Hospitalier et Universitaire de Poitiers, Poitiers :
http://www.poitou-charentes.inra.fr/ses_ressources/plateforme_ibisa_...
Greffes intestinales, Unité de Support Nutritionnel et de Greffe Intestinale et INSERM (ERI-21), CHU de Nice, Hôpital l'Archet 2, Nice
| Bibliographie |
Articles :
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