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 Ostreococcus tauri

     

 Contact 

Hervé MOREAU, UMR 7628 Observatoire océanologique de Banyuls-Sur-Mer, équipe Génomique évolutive et environnementale du Phytoplancton

 Mode de reproduction 

Organisme haploïde se divisant essentiellement par mitose, mais capable de reproduction sexuée
Temps de génération en culture : environ 2 divisions par jour.


 Disciplines principales 

Génétique
Génomique
Génétique et génomique comparées
Biologie cellulaire
Evolution
Ecologie
Etude du cycle cellulaire
Biochimie
Métabolisme
Photosynthèse
Etude des rythmes circadiens


 Infrastructures 

UMR 7628 Observatoire océanologique de Banyuls-Sur-Mer, équipe Génomique évolutive et environnementale du Phytoplancton :
http://www.obs-banyuls.fr/UMR7628/equipes/n6/team.php



 Introduction 

A ce jour, l'algue verte Ostreococcus tauri (O. tauri) est le plus petit organisme eucaryote libre décrit et possède le plus petit génome connu pour un eucaryote photosynthétique. Cette algue est très répandue dans toutes les mers du monde, et constitue un élément du phytoplancton. Elle est, avec les cyanobactéries et les picoeucaryotes photosynthétiques, le premier maillon de la chaîne alimentaire dans les océans, utilisant l’énergie solaire et fixant le dioxyde de carbone pour produire de la matière organique dont se nourrissent les autres organismes. Environ 50% de l’oxygène que nous respirons est issu de ce processus photosynthétique réalisé par les organismes unicellulaires du phytoplancton. L’intérêt suscité par cette algue verte planctonique unicellulaire s’explique à la fois par son intérêt comme organisme modèle pour étudier le phytoplancton marin, et par sa position évolutive à la base de la lignée verte menant aux plantes supérieures. De ce fait, O. tauri partage avec les plantes beaucoup de mécanismes physiologiques et moléculaires. Ainsi, la plupart des gènes présents spécifiquement dans le règne végétal sont présents chez O. tauri. Les génomes de trois souches ont été entièrement séquencés et les études permettant d'élucider la fonction des gènes conservés entre ces algues « primitives » et les plantes supérieures va permettre de mieux comprendre la fonction et la régulation des gènes homologues chez les plantes, ainsi qu'à la manière dont ils ont évolué.


 Données générales 

Ostreococcus tauri Classification phylogénétique : Chlorophyta de la famille des Prasinophyceae, ordre des Mamiellales. Les génomes des souches O. tauri, O. lucimarinus et RCC809 sont séquencés.
Ces génomes ont une taille d’environ 12,513 millions de paires de bases sur 20 à 21 chromosomes. Nombre de gènes prédits : environ 8000 gènes


 Outils disponibles 

Banques BACs, shot-gun, ESTs,
Nombreuses souches d’Ostreococcus


 Databases 

Bases de données générales :
http://genome.jgi-psf.org/Ostta4/Ostta4.home.html
http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bfind?O.tauri


 Bibliographie 

Sites web :
http://www.inra.fr/les_recherches/exemples_de_recherche/ostreococcus_tauri_ancetre_des_plantes
http://en.wikipedia.org/wiki/Ostreococcus
http://www.spectrosciences.com/breve.php3?id_breve=205

Articles :
« Genome-Wide Analysis of Core Cell Cycle Genes in the Unicellular Green Alga Ostreococcus tauri », Robbens S., Khadaroo B., Camasses A., Derelle E., Ferraz C., Inze D., Van de Peer Y., and Moreau H., Molecular Biology and Evolution, 2004 (disponible ici).
« Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features », Derellea E., et al., PNAS, 2006 (disponible ici).
« Ostreococcus tauri: seeing through the genes to the genome », Patrick J. Keeling, TRENDS in Genetics, 2007 (disponible ici).