Une propriété fondamentale des Légumineuses, qui est largement responsable de leur intérêt agronomique, est leur aptitude à fixer l'azote par la symbiose avec Rhizobium (bactéries aérobies du sol), aptitude qui explique la forte teneur en protéines de ces plantes et qui permet cette synthèse de protéines sans avoir recours à une fertilisation azotée chimique. Depuis quelques années, de nombreux laboratoires utilisent la luzerne tronquée, ou Medicago truncatula (M. truncatula) pour étudier divers aspects des interactions plantes-microorganismes. Le génome de M. truncatula présente une grande synténie avec les espèces de Légumineuses les plus cultivées en Europe, comme le pois ou la luzerne cultivée (M. sativa). C'est une espèce diploïde et son génome (sept fois plus petit que celui du pois) permet d'accéder rapidement aux séquences génomiques et de produire des mutants pour des analyses de génétique fonctionnelle. Le développement des recherches sur cette Légumineuse modèle fournira des outils importants pour la génétique et l'amélioration des Légumineuses cultivées, que ce soit pour la recherche fondamentale, ou dans le domaine de la recherche privée.
Medicago truncatula
Classification phylogénétique : légumineuse du groupe des Galégoïdes et plante de la famille des fabaceae.
Séquençage du génome exprimé en draft complet.
450 millions de paires de bases (3 à 4 fois supérieure à celle d'A. thaliana et équivalente à celle du riz) sur 8 chromosomes.
Diploïde vrai
Nombre de gènes : environ 30 000
Collection de variants naturels et mutants induits
Mutagenèse par la méthode de Tilling
Mutagenèse insertionnelle (plus de 200 000 insertions dans M. truncatula ssp. tricycla R108)
Transgenèse (via transformation par Agrobacterium tumefaciens et embryogenèse somatique)
Invalidation de gènes par RNAi
Analyses transcriptomiques
Banques d'ESTs, de cDNA
Outils bioinformatiques
Bases de données générales :
http://www.medicago.org/
http://www.noble.org/
http://www.noble.org/MedicagoHandbook/
http://www.legoo.org/
Bases de données génomiques :
http://mips.gsf.de/proj/plant/jsf/medi/download/index.jsp
http://www.tigr.org/tdb/e2k1/mta1/
Base de données de génomique comparée :
http://www.comparative-legumes.org/
Base de données transcriptomiques :
http://bioinfo.noble.org/gene-atlas/
http://lily.cebitec.uni-bielefeld.de/truncatulix/app
http://www.genxpro.info/science_and_technologies/
Banque de données d'ESTs :
http://compbio.dfci.harvard.edu/tgi/cgi-bin/tgi/gimain.pl?gudb=medicago
Banque de variants naturels :
http://195.220.91.17/legumbase/index.php
Banque de mutants d'insertion :
http://bioinfo4.noble.org/mutant/
Base de données de Tilling :
http://revgenuk.jic.ac.uk/
