Contact génomique : Claire ROGEL-GAILLARD, INRA/AgroParisTech, UMR1313, Laboratoire de Génétique Animale et Biologie Intégrative, équipe INRA-CEA Génétique Immunité Santé,
Jouy-en-Josas, 
Contact Biologie du développement : Véronique DURANTHON, UMR 1198 INRA-CNRS-ENVA, Biologie du Développement et Reproduction, Jouy-en-Josas,
Contact transgenèse : Geneviève JOLIVET, UMR 1198 INRA-CNRS-ENVA, Biologie du Développement et Reproduction, Jouy-en-Josas, genevieve.jolivet(at)jouy.inra.fr
Oryctolagus cuniculus
Classification phylogénétique : mammifère de la famille des Leporidae, sous-famille des Leporinae, ordre des lagomorphes
Taille attendue du génome : 2,8 Gb
Séquençage du génome par le Broad Institute :
http://www.broadinstitute.org/models/europeanrabbit
Séquence shotgun 2X disponible depuis 2005, séquençage 7X en cours de finition
| Reproduction et lactation |
Une lapine peut produire entre trois et dix-huit petits, tous les trois mois, avec une durée de gestation de 28 à 31 jours. En période de lactation, une femelle secrète près de 250 millilitres de lait par jour, ce qui permet de collecter jusqu’à 15 litres de lait par an et par individu. Cette caractéristique rend l’espèce lapin particulièrement intéressante pour la production de protéines recombinantes dans le lait.
Biologie du développement
Biologie cellulaire
Biologie moléculaire
Transgenèse
Immunologie
Génétique
Génomique comparative
Modèle de maladies humaines, Pathologies pour lesquelles le lapin est reconnu comme un modèle de choix :
Métabolisme des lipides, athérosclérose, cardiomyopathies
Carcinogenèse associée aux papillomavirus
Diabète, obésité
Maladies auto-immunes : asthme, arthrite, lupus
Maladies infectieuses : tuberculose, syphilis
Pathologies oculaires
Capacité d’élevage dans des conditions contrôlées
Banques de grands fragments d’ADN (BACs)
Transfections cellulaires
Transgenèse
Clonage somatique
Carte intégrée génétique et cytogénétique
Séquence 2X du génome et prochainement séquence 7X
Puces d’expression pour des analyses transcriptomiques
Anticorps
Standard des races :
Fédération française de cuniculiculture :
http://www.ffc.asso.fr/
American Rabbit Breeders Association :
http://www.arba.net/
Cartographie :
http://dga.jouy.inra.fr/cgi-bin/lgbc/main.pl?BASE=rabbit
Séquence du génome :
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/...
http://www.ensembl.org/Oryctolagus_cuniculus/Info/Index
Annotation et cartographie comparée d’EST :
http://bioinfo.genotoul.fr/Iccare/index.php
http://www.sigenae.org/
L’espèce lapin (Oryctolagus Cuniculus) est apparue dans la péninsule ibérique au milieu du Pléistocène. Sa domestication est récente (premières sélections au moyen-âge) et c'est l'une des rares espèces de mammifère qui coexiste à l’état sauvage et domestiqué. Environ 90 races pures de lapin sont référencées et représentent des mutants naturels pour des caractères multiples.
Outre son exploitation comme animal d’intérêt économique, le lapin est également un modèle de laboratoire et de recherche biomédicale : il est prolifique, de petite taille et vit dans des conditions d’élevage facilement contrôlables. La physiologie du lapin est bien décrite et, chez cette espèce, la réponse immunologique aux antigènes est excellente, permettant la production d’anticorps spécifiques. Des souches porteuses de mutations diverses et des souches issues des nombreuses races sélectionnées sont disponibles pour mener des études génétiques. En recherche biomédicale, le lapin est exploité pour des études de toxicologie et constitue un bon modèle pour la chirurgie expérimentale. Sur le plan de la bio-ingénierie, des protéines recombinantes sont produites commercialement. Le premier clonage de lapin à partir de cellules adultes a été rapporté en 2002, clonage reproduit depuis par plusieurs équipes. Actuellement, des recherches actives sont menées pour produire des cellules souches embryonnaires de lapin qui ouvriraient de grandes possibilités en recherche fondamentale. Enfin, le lapin est considéré comme un modèle plus représentatif de la plupart des mammifères que ne l’est la souris, pour étudier les premières étapes du développement : en particulier la période d’activation transcriptionnelle du génome embryonnaire et de la gastrulation. Plus tard, la structure de son placenta et son métabolisme lipidique en font un modèle pertinent de l’homme pour analyser les phénomènes de programmation fœtale. Le lapin est également considéré comme une espèce remarquable pour étudier les processus de domestication et les signatures génétiques qui y sont associées.
Souches de lapin sélectionnées à l’INRA :
UR631 Amélioration génétique des animaux SAGA, équipe lapin :
http://www.inra.fr/compact/nav/externe/fr/...
http://www.inra.fr/genetique_animale/les_unites/...
Banques de BAC :
CRB GADIE, Jouy-en-Josas, France :
http://crb-gadie.inra.fr/
BACPAC resources center, USA :
http://bacpac.chori.org/
Production de puces à ADN :
CRB GADIE, Jouy-en-Josas, France :
http://crb-gadie.inra.fr/
Démarrage d‘un programme de détection de SNP
Biologie du développement, cellules souches, clonage :
INRA, UMR1198 Biologie du développement et de la reproduction, Jouy-en-Josas, France
http://www.inra.fr/compact/nav/externe/fr/unites...
Epigénétique, topologie nucléaire
INRA, Génomique et Physiologie de la Lactation, Jouy-en-Josas, France
http://w3.jouy.inra.fr/unites/gpl/index.shtml
Bioingénierie
BioProtein technologies, Jouy-en-Josas, France
http://www.bioprotein.com/fr/open.htm
Cartographie et cytogénétique
INRA/AgroParisTech, UMR 1313 de Génétique Animale et Biologie Intégrative, Jouy-en-Josas, France
http://www.inra.fr/genetique_animale/les_unites/...
Etude du complexe majeur d’histocompatibilité
INRA/AgroParisTech, UMR1313, Laboratoire de Génétique Animale et Biologie Intégrative, équipe INRA-CEA Génétique Immunité Santé, Jouy-en-Josas
http://www.inra.fr/genetique_animale/les_unites/...
Couleur
INRA, Station d’Amélioration Génétique des Animaux, Toulouse, France
http://www.inra.fr/genetique_animale/les_unites/...
Développement embryonnaire et fœtal, comportement animal et étude des réponses immunitaires :
INRA, UCEA : Unité Commune d'Expérimentation Animale :
http://www.jouy.inra.fr/ressources_scientifiques/...
