| L'ascidie |
| Contact |
Jean-Stéphane JOLY, UPR 3294 NED Neurobiologie Et Développement, CNRS, Gif-sur-Yvette 
Patrick LEMAIRE, CRBM, CNRS/Univ. Montpellier 1 et 2, Montpellier
Laurent LEVEQUE, Station Biologique de Roscoff, Service Mer et Observation,
| Mode de reproduction |
Les ascidies sont hermaphrodites. La fécondation a lieu dans l'eau et donne naissance à une larve de 2 à 3 mm de long en forme de tétard : elle présente une tête et une grande queue effilée qui lui permet de se déplacer dans l'eau. Cette queue constitue la caractéristique principale de la larve puisqu'elle contient une corde dorsale appelée notocorde (élément qui permet de classer les ascidies dans le phylum des chordés). A l'avant de la larve, se trouvent trois papilles adhésives qui vont lui permettre de se fixer dans les 12 à 24 heures qui suivent sa formation soit au sol, soit sur tout substrat dur où elle pourra entamer sa métamorphose. Dès les premières heures, la queue, avec sa notocorde et son axe nerveux, se résorbe jusqu'à disparaître complètement chez l'individu adulte. Les papilles adhésives croissent pour former un pédoncule qui surélève le corps de l'animal. Les différents organes vont alors se développer. Le passage de la larve à l'ascidie adulte s'effectue en une vingtaine de jours.
| Outils disponibles |
Possibilité d'obtention d'un grand nombre d'embryons par fécondation in vitro à partir d’adultes sauvages récoltés à la station biologique de Roscoff ou à celle de Sête (Montpellier).
Possibilité d'obtention d'animaux transgéniques par électroporation d'œufs déchorionés ou de façon stable par des techniques d’injection de transposase (minos).
Analyses fonctionnelles par invalidation de gènes via injection de morpholinos (oligonucléotides antisens) ou par mutagenèse.
Banques d'ESTs, de cDNA, de BAC et de cosmides.
Elevage par la plateforme AMAGEN.
| Disciplines principales |
Génétique
Biologie évolutive
Biologie du développement
Biologie des systèmes
Etude de l'évolution et du développement du système nerveux et d’autres tissus
| Infrastructures |
Plateforme GIS-AMAGEN :
http://amagen.inaf.cnrs-gif.fr/
Station biologique de Roscoff. Fourniture d’animaux sauvages sexuellement actifs d’avril à décembre. Essai d’extension de la période d’activité sexuelle par élevage.
http://www.sb-roscoff.fr/ModBiol/
Laboratoire de Biologie du Développement - BioDev UMR7009 CNRS, Université Pierre et Marie Curie, Paris VI, Observatoire océanologique de Villefranche-sur-Mer :
Equipe Fécondation et contrôle du cycle méiotique, groupe d'Alex McDougall
Equipe BioMarCell : Fécondation et polarisation des embryons d'invertébrés marins, groupe de Christian Sardet
Equipe Spécification des précurseurs embryonnaires, groupe de Hitoyoshi Yasuo
| Introduction |
Les urochordés (ou tuniciers) constituent un modèle extrêmement intéressant pour décrypter les réseaux génétiques de développement précoce. De plus, ils sont très proches des vertébrés ce qui permet de documenter quels étaient les caractères (types cellulaires par exemple) déjà présents il y a plus de 500 millions d’années chez les chordés et à partir desquels les innovations de vertébrés ont eu lieu. La cione Ciona intestinalis (C. intestinalis), dont l'élevage et la manipulation en laboratoire sont réalisés dans quelques laboratoires, est l'une des espèces d'urochordés les plus étudiées. Elle représente un modèle d'étude traditionnel en biologie du développement depuis de nombreuses années. Aujourd'hui le séquençage de son génome constitue une formidable avancée pour la connaissance de l'origine du génome des vertébrés.
| Données générales |
Concernant Ciona intestinalis :
Classification phylogénétique : chordé du genre cionidae
Genome séquencé
Environ 160 millions de paires de bases sur 14 chromosomes
Nombre de gènes : environ 16 000
Anatomie de l’embryon facile à décrire (lignage fixe, peu de cellules)
Plus d’un million d’ESTs
40 000 profils d’expressions
Concernant Ciona savignyi :
Genome sequencé
ESTs
Modèle de genes (ENSEMBL)
Concernant Phallusia mamillata
Genome probablement séquencé en 2009 - 2010
Embryon transparent et en quantité énorme
Concernant Halocynthia roretzi :
80000 ESTs environ
Modèle japonais
| Databases |
Un grand nombre de base de données et de sites web relatifs à l’ascidie sont répertoriés sur ce portail :
http://www.tunicate-portal.org/
Bases de données générales :
ANISEED (génomique, littérature, données d'expression et anatomie) :
http://www.aniseed.cnrs.fr/
Ghost (génomique, expression) :
http://ghost.zool.kyoto-u.ac.jp/indexr1.html
Bases de données spécialisées :
Expression :
CiAID :
http://bioinfo.s.chiba-u.jp/ciaid/
CINOBI :
http://hottapc.lab.nig.ac.jp/notochord/cibra/
MAGEST :
http://magest.hgc.jp
Anatomie :
FABA/FABA2 :
http://chordate.bpni.bio.keio.ac.jp/faba/top.html
ESTs :
http://informatics.gurdon.cam.ac.uk/online/ciona-fl-db.html
Protéomique :
CIPRO :
http://cipro.ibio.jp
Regions régulatrices :
DBTGR :
http://dbtgr.hgc.jp
Puces à ADN :
http://goblet.molgen.mpg.de/cgi-bin/webapps/ciona.cgi
Biologie du développement : Ascidian film archive de l'UMR7009 de l'Observatoire océanologique de Villefranche-sur-Mer :
http://biodev.obs-vlfr.fr/recherche/biomarcell/films...
Liens supplémentaires :
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?...
http://www.ensembl.org/Ciona_intestinalis/Info/Index/
http://www.ciona.cnrs-gif.fr
| Bibliographie |
Sites web : |
